Направление «Математика и компьютерные науки» реализует магистерскую программу «Методы математического и алгоритмического моделирования общенаучных и прикладных задач» (20 студентов), нацеленную на решение различных задач моделирования действующих месторождений на основе суперкомпьютерных технологий.